Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek6Q9ES70 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nek6Q9ES70 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms