Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ush1cQ9ES64 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ush1cQ9ES64 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms