Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Wdr61Q9ERF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Wdr61Q9ERF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Wdr61Q9ERF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms