Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn4aQ9ER60 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn4aQ9ER60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn4aQ9ER60 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn4aQ9ER60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms