Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spock2Q9ER58 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spock2Q9ER58 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spock2Q9ER58 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms