Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn12Q9ER56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn12Q9ER56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms