Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms