Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbp7Q9EPC5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbp7Q9EPC5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp7Q9EPC5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms