Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Eif3fQ9DCH4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3fQ9DCH4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms