Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt112Q9DCG9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt112Q9DCG9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt112Q9DCG9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt112Q9DCG9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt112Q9DCG9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt112Q9DCG9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt112Q9DCG9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt112Q9DCG9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms