Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pak1ip1Q9DCE5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pak1ip1Q9DCE5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pak1ip1Q9DCE5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms