Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc97Q9DBT3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc97Q9DBT3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms