Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ftsj3Q9DBE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ftsj3Q9DBE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ftsj3Q9DBE9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms