Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenooQ9DBC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenooQ9DBC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenooQ9DBC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms