Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med27Q9DB40 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms