Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smdt1Q9DB10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smdt1Q9DB10 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms