Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc54Q9DAL3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc54Q9DAL3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms