Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms