Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc89Q9DA73 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms