Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd8Q9DA37 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd8Q9DA37 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd8Q9DA37 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms