Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco2Q9DA21 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco2Q9DA21 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.6 ms