Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA19

Cir1, Corepressor interacting with RBPJ 1, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cir1Q9DA19 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cir1Q9DA19 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cir1Q9DA19 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms