Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp12Q9D9M2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp12Q9D9M2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp12Q9D9M2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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