Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q9D9H8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9H8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q9D9H8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9H8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms