Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Speer4bQ9D9F7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4bQ9D9F7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4bQ9D9F7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms