Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SlirpQ9D8T7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlirpQ9D8T7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms