Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rexo2Q9D8S4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo2Q9D8S4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms