Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan17Q9D7W4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan17Q9D7W4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms