Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr2dQ9D7M8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2dQ9D7M8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2dQ9D7M8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms