Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms