Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4cQ9D7F7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp4cQ9D7F7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp4cQ9D7F7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms