Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9D7E4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms