Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms