Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc2Q9D6K8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fundc2Q9D6K8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms