Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ShpkQ9D5J6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms