Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam227bQ9D518 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam227bQ9D518 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms