Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms