Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms