Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf128Q9D304 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf128Q9D304 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms