Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms