Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930583I09RikQ9D2E3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930583I09RikQ9D2E3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms