Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krtap5-3Q9D226 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krtap5-3Q9D226 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms