Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2cQ9D1C1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ube2cQ9D1C1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ube2cQ9D1C1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2cQ9D1C1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms