Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syf2Q9D198 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms