Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem53Q9D0Z3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem53Q9D0Z3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms