Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem88Q9D0N8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem88Q9D0N8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms