Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed3Q9D0L1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed3Q9D0L1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed3Q9D0L1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms