Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp3Q9D032 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms