Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CenpnQ9CZW2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CenpnQ9CZW2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms