Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3bQ9CZT8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3bQ9CZT8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms